thesis

Séquençage de la translocation t(12 ; 16) dans un liposarcome myxoïde : application au diagnostic moléculaire

Defense date:

Jan. 1, 1996

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Institution:

Lyon 1

Disciplines:

Directors:

Abstract EN:

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Abstract FR:

A partir de tissu tumoral provenant d'un liposarcome myxoide, nous avons confirme l'implication du gene gadd 153 (growth arrest and dna damage inducible) sur le chromosome 12 et du gene tls (translocated in liposarcoma) sur le chromosome 16 dans le processus de translocation t(12 ;16)(q13 ;p11), que ce soit au niveau de la tumeur primitive ou d'une des metastases. De meme, nous montrons que le tissu tumoral produit un arn fusion tls-gadd 153 identique a celui decrit dans la litterature. La constitution d'une banque genomique a partir de l'adn tumoral a permis de sous-cloner les deux bras de la translocation 12/16 et 16/12 ainsi que le fragment implique du chromosome 12. Le fragment implique du chromosome 16 a ete obtenu par une technique de pcr. Les fragments d'interet 12, 16, 12/16 et 16/12 ont ete sequences. L'analyse des sequences suggere: 1/ que la translocation etudiee resulte d'un phenomene d'echange par recombinaison homologue conservatrice mais symetrique ; 2/ que cet echange est dirige par la cassure du chromosome 12. Une technique de pcr permettant d'obtenir facilement les differents fragments de la translocation a ete mise au point a partir de l'adn genomique de la tumeur etudiee. Elle a ete appliquee a l'etude d'autres adn d'une serie de tumeurs liposarcomateuses et d'autres origines, ainsi qu'a celle de l'adn de sujets normaux. Le produit de la pcr revelant le bras 12/16 de la translocation a ete constamment retrouve dans les liposarcomes alors que la pcr revelant la contre partie 16/12 n'est jamais visible. L'analyse du produit de la pcr revelant le bras 12/16 montre que le point de cassure sur le chromosome 12 est identique dans tous les liposarcomes etudies. Ces resultats semblent indiquer que le point de cassure sur le chromosome 16 apparait de facon aleatoire alors que le point de cassure sur le chromosome 12 proviendrait du mecanisme de recombinaison qui est a l'origine de la translocation. Notre travail ouvre des perspectives de travaux complementaires pour la comprehension du phenomene de cancerisation et des mecanismes de deregulation qui president a la survenue des etats inflammatoires chroniques, en particulier en rhumatologie