Abstract FR:

Neosartorya fischeri et byssochlamys nivea sont deux champignons filamenteux thermoresistants. Zygosaccharomyces bailii est une levure capable de se developper sur des milieux tres varies, meme en presence de quantites importantes de conservateurs. De par leurs caracteristiques, ces trois micro-organismes contaminants de produits alimentaires sont responsables de pertes economiques importantes. Afin de minimiser ces pertes, un test de detection specifique rapide et sensible est presente. Une etude preliminaire a la mise au point du test est realisee pour z. Bailii ainsi que pour n. Fischeri la position phylogenetique des differentes especes du genre zygosaccharomyces est obtenue par comparaison des sequences partielles de l'adn ribosomique 18s. L'etude du polymorphisme du genre neosartorya, basee sur la comparaison des sequences des regions its et du gene de la beta tubuline-2 est discutee. La cible du test est situee dans une region polymorphe de l'unite ribosomique (its: internal transcript spacer), amplifiee par pcr. Apres clonage et determination de la sequence nucleotidique des its, un couple d'oligonucleotides amorce specifique est choisi pour chaque micro-organisme. Leur specificite est verifiee en testant des especes plus ou moins proches phylogenetiquement. Le test est ensuite mis au point dans la confiture de fraise, choisie comme systeme modele. Plusieurs etapes necessaires a l'obtention du produit d'amplification sont proposees: liquefaction de la confiture de fraise, concentration des micro-organismes, extraction et purification rapide de l'adn des micro-organismes. Differentes propositions sont faites afin d'optimiser ce test pour son utilisation en routine. En complement de ce test, une methode d'identification rapide des levures du genre zygosaccharomyces est presentee, ainsi qu'une sonde epidemiologique caracteristique de b. Nivea