thesis

Le systeme de recombinaison specifique de site d'un phage tempere d'une bacterie a gram positif, lactobacillus delbrueckii

Defense date:

Jan. 1, 1998

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Institution:

Toulouse 3

Disciplines:

Directors:

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Abstract FR:

L'integration du genome du phage tempere mv4 dans le chromosome de la bacterie hote lactobacillus delbrueckii se produit par recombinaison entre le site phagique attp et le site bacterien attb. La recombinaison est catalysee par une recombinase specifique de site, de la famille des integrases. Cet evenement genere les sites hybrides attl et attr qui sont les sites substrats de la reaction inverse (excision). Les sites attp, attb, attl et attr ont ete sequences. La sequence cur, commune a ces quatre sites, a l'interieur de laquelle se fait l'echange des brins d'adn, a ete identifiee. Le phage mv4 insere son genome dans le gene d'un arnt#s#e#r, sans interrompre celui-ci. Un vecteur integratif (pmc1) contenant le gene de l'integrase et le site attp, a ete construit. Il possede un large spectre d'hote. Le sequencage des sites d'insertion de ce vecteur dans diverses especes bacteriennes a gram positif nous a permis de determiner une sequence attb consensus et d'identifier les nucleotides bacteriens importants pour le fonctionnement de ce site. Afin d'etudier plus en detail le mecanisme de recombinaison, des tests de recombinaison ont ete realises in vitro et in vivo chez escherichia coli. Contrairement a d'autres systemes phagiques, la recombinaison integrative ne requiert ni la presence de la proteine ihf d'e. Coli, ni la presence d'un facteur specifique de lb delbrueckii. Le site attb a une structure simple : il correspond a une sequence minimale de 16 pb qui, contrairement a d'autres systemes, n'est pas symetrique. Le site attp est beaucoup plus complexe : il possede une longueur minimale de 234 pb et doit etre surenroule negativement pour etre actif. Il comprend cinq sites potentiels de fixation de l'integrase. Ces donnees suggerent la formation sur le site attp d'un complexe nucleoproteique d'ordre superieur (intasome). Par ailleurs, l'integrase est capable d'effectuer la reaction d'excision in vivo dans e. Coli, en absence de tout autre facteur phagique.