thesis

Effet de la plante et du sol sur la diversite des populations telluriques de Pseudomonas SPP. Fluorescents

Defense date:

Jan. 1, 1996

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Institution:

Dijon

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Abstract FR:

Les pseudomonas SPP. Fluorescents sont des bactéries antagonistes de nombreux champignons phytopathogènes. La protection biologique des cultures, assurée par certaines souches, résulte de leurs activités antagonistes et de leur aptitude à se maintenir dans la rhizosphère de la plante inoculée. Les caractères microbiens responsables de l'adaptation des Pseudomonas SPP. Fluorescents à la rhizosphère sont relativement méconnus. Afin de mieux comprendre le déterminisme de l'adaptation à la rhizosphère de ces bactéries, les caractéristiques de Pseudomonas SPP. Fluorescents isolés de sols nus et de racines de plantes cultivées sur ces mêmes sols ont été comparées. L'étude a porté sur plus de 600 souches isolées de 2 sols ou des racines de lin et tomate cultivées dans ces mêmes sols. La diversité a été évaluée aux niveaux phénotypique (tests biochimiques et physiologiques) et génotypique (PCR-RFLP du 16S, PCR-REP, profils plasmidiques). La distribution des isolats au sein des différents phénons en fonction de leur origine montrent clairement que (i) la plante exerce une sélection à l'égard des populations de Pseudomonas SPP. Fluorescents, et cette sélection est en partie spécifique de l'espèce végétale ; (ii) les populations de Pseudomonas SPP. Fluorescents diffèrent d'un sol nu a l'autre ; (iii) les populations associées à une même espèce végétale diffèrent également d'un sol à l'autre. Les résultats obtenus suggèrent que la pression de sélection exercée par la plante est liée au métabolisme basal des Pseudomonas et plus particulièrement à leur aptitude à assimiler certains substrats organiques et a réduire les nitrates