Etude structurale et fonctionnelle du complexe d'initiation de la transcription inverse du virus de l'immunodeficience humaine de type 1 (hiv-1)
Institution:
Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)Disciplines:
Directors:
Abstract EN:
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Abstract FR:
La transcription inverse de l'arn genomique en adn est une etape cle du cycle retroviral. Lors de ce travail, nous avons etudie les parametres structuraux et fonctionnels qui determinent la specificite de l'initiation de la transcription inverse de hiv-1. Une etude structurale detaillee du complexe binaire matrice/amorce forme de la region pbs de l'arn viral et du tarn#3#l#y#s servant d'amorce a montre que les interactions entre les deux arn ne sont pas limitees a l'interaction cannonique tarn/pbs, mais impliquent des rearrangements intra- et intermoleculaires conduisant a un complexe organise autour d'un cur tres structure. Nous avons montre que les nucleotides modifies du tarn#3#l#y#s jouent un role essentiel dans l'etablissement et la stabilisation des interactions additionnelles entre les deux arn. Par ailleurs, ces interactions subsitent dans le complexe ternaire arn viral/tarn#3#l#y#s/rt. Au cours de la polymerisation, l'addition du troisieme nucleotide s'accompagne d'une ouverture de la structure secondaire formee lors l'initiation de la transcription inverse. Nous avons teste la specificite de la transcription inverse du point de vue fonctionnel en comparant le comportement de differentes amorces, naturelle ou synthetiques, en presence de la rt de hiv-1 ou de rt heterologues. Nous avons montre que la transcription inverse est un processus biphasique, avec une etape d'initiation specifique, dependante des bases modifiees du tarn#3#l#y#s et de la rt homologue, suivie d'une etape d'elongation non-specifique. La transition efficace entre les deux etapes requiert les interactions additionnelles matrice/amorce. Des experiences similaires menees chez d'autres retrovirus suggerent que ce mecanisme biphasique pourrait etre une regle generale. Ainsi, de par ses specificites structurales et fonctionnelles, l'initiation de la transcription inverse pourrait constituer une cible privilegiee pour des agents therapeutiques