Abstract FR:

L'objectif de ce travail etait de reconstruire une phylogenie moleculaire des iridaceae a l'aide du gene chloroplastique rps4 et de regarder a l'aide de ce meme outil, les relations phylogenetiques des iridaceae avec les autres familles du superordre des lilianae. Nous nous sommes interesse egalement aux origines (monophyletiques ou non) de certains ordres qui composent ce superordre. Les resultats obtenus pendant ce travail de these ont montre que le gene rps4 est un bon outil pour la reconstruction phylogenetique des iridaceae. Ce gene evolue a une vitesse appropriee qui permet d'etablir les relations phylogenetiques au sein de cette famille. Nos resultats sont concordants avec la classification etablie par goldblatt (1990) en ce qui concerne la division de la famille en quatre sous-familles. Nous avons montre qu'il existe une importante correlation entre la distribution biogeographique et l'evolution dans la sous-famille des iridoideae. Le gene rps4 apporte tres peu de resolution phylogenetique au sein de la sous-famille des ixioideae, ce qui suggere une radiation rapide de cette sous-famille. Nos donnees montrent que les iridaceae sont plus proches des asparagales que de liliales, l'ordre dans auquel appartiennent les iridaceae selon la classification de goldblatt. Nous avons trouve egalement que seul l'ordre des orchidales a une origine monophyletique, les trois autres analyses (liliales, asparagales et dioscoreales) sont paraphyletiques ou polyphyletiques. Le dernier point discute dans ce travail concerne l'utilisation du gene rps4 dans les reconstructions phylogenetiques et les differents taux d'evolution de ce gene bases sur un echantillonnage important de trois familles de plantes monocotyledones (poaceae, iridaceae et arecaceae)