thesis

Determination d'enveloppes de macromolecules biologiques par la methode de variation de contraste par diffusion anomale en cristallographie des rayons x (methode masc : multiwavelength anomalous solvent contrast)

Defense date:

Jan. 1, 1999

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Institution:

Paris 11

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Abstract FR:

La connaissance de l'enveloppe d'une macromolecule biologique peut-etre tres utile dans l'obtention de la structure tridimensionnelle de celle-ci a l'echelle atomique. La methode masc (un acronyme pour multiwavelength anomalous solvent contrast) est une nouvelle methode de determination d'enveloppes de macromolecules biologiques en cristallographie des rayons x, qui combine la methode de variation de contraste et le phenomene de dispersion anomale. Cette methode permet l'etude d'entites de masse moleculaire tres elevee (cf virus ou ribosome). Cette these presente les premieres experiences masc realisees a basse temperature (120 kelvin) sur trois proteines de masses moleculaires variees et pour differents diffuseurs anomaux. Apres traitement des donnees de diffraction, l'extraction des modules de facteurs d'enveloppes experimentaux fournit un bon accord avec ceux tires des modeles basse temperature pour une resolution inferieure a 20 angstrms. La prise en compte de sites ordonnes, prouves pour chacune des proteines, permet d'ameliorer substantiellement l'accord entre modele et experience jusqu'a une resolution superieure a 4 angstrms pour une des proteines. La derniere partie de la these est consacree au phasage des facteurs d'enveloppe, necessaire a l'obtention de l'enveloppe. L'utilisation de methodes traditionnelles de phasage ayant fourni des resultats mitiges, une nouvelle parametrisation operationnelle des enveloppes est presentee, ainsi qu'un traitement mathematique utilisant les methodes de maximum de vraisemblance pour le classement d'hypotheses d'enveloppes.