Recherche de gènes modulant le phénotype de la maladie de Crohn
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Paris 6Disciplines:
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La maladie de Crohn (MC) est une maladie multifactorielle complexe liée à des facteurs de risque environnementaux et génétiques. Des études récentes ont identifié de très nombreux polymorphismes (SNPs) de susceptibilité, qui pour la plupart augmentent faiblement le risque de développer une MC. Les facteurs génétiques sont potentiellement de bons paramètres pour classifier les patients en termes de localisation, de sévérité, de complications et de réponse/toxicité aux traitements. Ce travail a consisté à rechercher des facteurs génétiques modulant le phénotype MC. Les données phénotypiques détaillées d’une cohorte de 798 patients atteints de MC ont été recueillies. Ces patients et des 960 témoins sains ont été génotypés pour 53 SNPs de susceptibilité à la MC publiés. Les corrélations génotypes/phénotypes ont été effectuées et l’influence du nombre de gènes dans la prédiction diagnostique et évolutive a été étudiée en définissant le risque de développer une MC en fonction du nombre de gènes à risque porté, en recherchant les epistasies et en traçant les courbes ROC. Cette étude confirme le rôle de NOD2 dans la MC iléale, souligne le rôle de l’IL23R et de la DEFB1 dans les maladies coliques, et l’implication de IRGM et ATG16L1 dans les formes compliquées. Les autres SNPs de susceptibilité ne modifient pas la présentation clinique de la MC. Cette étude montre que la mise en évidence d’un grand nombre d’allèles contribuant chacun faiblement au risque génétique de développer une MC ne permet pas de prédire la survenue de la maladie, ni même sa présentation clinique. Ce travail renforce l’idée que le typage des patients en pratique clinique n’a aujourd’hui pas d’intérêt