Etude des relations structure-fonction de la proteine cftr et de l'atpase h+,k+ gastrique
Institution:
Paris 7Disciplines:
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Abstract FR:
Nous avons etudie les relations structure-fonction des proteines a partir de leurs sequences primaires en utilisant des methodes fondees sur la repartition de l'hydrophobicite et sur l'homologie de sequence. Nous nous sommes interesses a deux proteines membranaires ; la cftr et l'atpase h#+,k#+ gastrique. La premiere est un canal chlorure localise au pole apical de l'epithelium, active par l'hydrolyse d'atp et regule par l'ampc. Sa mutation f508 est a l'origine de la mucoviscidose. L'atpase h#+,k#+ gastrique est responsable de la secretion acide dans l'estomac. L'echange electroneutre h#+/k#+ provient d'un changement conformationnel de type e#1e#2 active par la fixation d'atp, la phosphorylation et la fixation d'ions k#+ sur la proteine. Nous avons mis au point une methode pour detecter les sites antigeniques des 2 proteines capables d'aboutir a des anticorps specifiques de bonne affinite. Cette methode est applicable a tous les types de proteines. Treize epitopes ont ete detectes sur la cftr, six sur l'atpase h#+,k#+. Quatre anticorps monoclonaux ont ete produits au laboratoire ; 1 anti-cftr et 3 anti-atpase. Ils sont tres specifiques de leurs proteines respectives. La structure des proteines membranaires est encore mal connue. Seules les methodes spectroscopiques et de prediction en modelisation moleculaire sont capables de donner une image de leurs conformations. Nous avons predit un modele tridimensionnel du canal chlorure de la cftr. Nous avons determine les acides impliques dans la conduction des ions, et montre l'existence possible d'un second pore, capable de transporter des molecules d'atp. Le meme type de travail est en cours pour determiner la structure du canal ionique de l'atpase h#+,k#+.