Mecanisme de regulation traductionnelle de la proteine s15 d'escherichia coli
Institution:
Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)Disciplines:
Directors:
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Abstract FR:
La proteine ribosomique s15 se fixe directement sur l'arnr 16s et regule sa propre synthese en se fixant sur son arn messager. La region de l'arnr 16s reconnue par s15 apparait comme une structure complexe en epingle a cheveux comportant des boucles internes asymetriques, des nucleotides en bulge et de nombreux appariements non canoniques. La deletion d'un a en bulge renforce la stabilite de l'helice et diminue l'affinite de s15. L'operateur traductionnel du gene rpso, situe dans la region 5' du messager, presente un equilibre dynamique entre une structure en tige-boucle et un pseudo-nud. S15 deplace l'equilibre vers le pseudo-nud. La regulation in vivo depend de la capacite de l'arnm a adopter la structure en pseudo-nud: les mutations qui empechent la formation du pseudo-nud abolissent la regulation. L'existence du pseudo-nud a ete prouvee par l'etude de mutations compensatoires in vivo et in vitro. Le pseudo-nud est formee de deux helices empilees de maniere coaxiale. L'une des helices contenant 7 paires de bases est traversee par un seul residu adenine. S15 protege une partie de chacune des deux helices et le nucleotide a joignant les deux helices. La modelisation graphique indique que s15 interagit du cote du grand sillon. Des experiences de toe-print ont ete utilisees pour suivre la formation du complexe d'initiation de la traduction ainsi que des experiences d'empreinte de la sous-unite 30s et de la proteine s15 sur l'arnm. Ces resultats montrent l'existence du mecanisme moleculaire de repression par blocage du ribosome: la fixation du represseur sur l'operateur bloque le complexe dans une conformation incapable d'assurer le demarrage de la traduction