Etude de l'organisation genomique et de la transcription inverse des spumavirus
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Paris 7Disciplines:
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Les spumavirus constituent un groupe important, et pourtant peu etudie, des retrovirus. Nous avons clone et sequence le genome complet du spumavirus simien de type 1 (sfv1). La construction d'un arbre phylogenetique des retrovirus permet, au niveau moleculaire, de classer les spumavirus comme un groupe autonome. L'analyse de la sequence de sfv1 revele un genome complexe, codant pour les genes habituels gag, pol, env, et des genes additionnels, appeles bell-2, situes entre env et la sequence terminale repetee (ltr) 3. Cette analyse revele egalement des caracteristiques originales. Le changement de cadre de lecture, entre gag et pol, se fait en +1. Les ltr (1,6 kb) et le genome (11,5 kb) sont tres longs. Notre etude a par ailleurs porte sur les intermediaires de replication du genome de sfv1 et du spumavirus humain. Nous avons pu mettre en evidence un intermediaire adn qui porte un site de sensibilite a l'action de la nuclease s1. Ce site est adjacent a une duplication de la sequence riche en purines (ppt), habituellement trouvee a la limite de la ltr 3. Ces resultats suggerent fortement un mecanisme de double initiation de la synthese du brin (+) de l'adn viral a partir des deux ppt et conduit a une modification du schema classique de la transcription inverse. Pendant la realisation de ces travaux nous avons mis au point une methode originale de preparation de l'adn de haut poids moleculaire qui est egalement decrite