Mecanisme d'activation de la protein g, arf1 : role coordonne des membranes lipidiques et du facteur d'echange, arno
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Arf1 est une petite proteine g impliquee dans le transport vesiculaire. Comme toutes les proteines g, elle existe sous 2 etats conformationnels differents : un etat inactif lie au gdp et un etat actif lie au gtp. Nous avons confirme qu'arf1 g d p interagit faiblement avec les membranes via des interactions electrostatiques et l'insertion de son myristate dans la bicouche lipidique. Nous avons montre qu'arf1 g t p est fortement lie aux membranes grace a l'insertion de son myristate et de residus de l'helice n-terminale, suite a la bascule de celle-ci. L'echange gdp-gtp d'arf1 est fortement active par le domaine sec7 du facteur d'echange nucleotidique arno. Arno possede egalement un domaine coiled-coil et un domaine ph, responsable de son recrutement a la membrane. L'interaction entre ces deux proteines a ete etudiee en solution en utilisant le domaine sec7 d'arno et une proteine arf1 tronquee de son helice, arf117. La resolution de la structure et des etudes de mutagenese nous ont permis de montrer que la gorge hydrophobe d'arno-sec7 est le siege de l'interaction avec arf1. Nous avons decouvert, grace a des mesures d'activite et des experiences de gel filtration, les sites d'interaction d'arf1 avec arno-sec7 : l'insertion de la region switch i d'arf1 dans la gorge hydrophobe du domaine sec7 et la formation d'une paire ionique entre la lysine 73 de la region switch ii d'arf1 et l'aspartate 183 de la gorge du domaine sec7. Nous avons egalement montre que le glutamate 156 du domaine sec7 est essentiel a la catalyse de l'echange nucleotidique car il vient destabiliser le magnesium et le phosphate du nucleotide. Nous avons donc appele ce residu le glutamic finger. Puis nous avons suivi la bascule de l'helice n-terminale suite a l'interaction d'arf1 avec arno-sec7 ce qui nous a permis de degager un modele dans lequel l'helice d'arf1 a bascule avant l'interaction avec arno-sec7 et ou arno-sec7 vient empecher la rebascule de l'helice.