Alcr, le transactivateur du regulon ethanol chez aspergillus nidulans : etude mutationnelle et approche structurale de la proteine et du complexe avec l'adn
Institution:
Paris 11Disciplines:
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Alcr, le regulateur transcriptionnel du regulon ethanol chez aspergillus nidulans, appartient a la famille des complexes binucleaires a zinc. Toutefois, il s'en singularise par de nombreux aspects qui ont fait l'objet de ce travail. Alors que les proteines de cette classe reconnaissent le plus souvent des cibles palindromiques et s'y fixent sous forme de dimeres, alcr reconnait des cibles directement et inversement repetees et se fixe sous forme de monomere. De plus, de facon surprenante, la liaison a une cible palindromique requiert la presence d'une sequence amino-terminale placee en amont du complexe a zinc et plus particulierement le residu arginine en position six. Cette sequence amino-terminale n'est pas requise pour la fixation sur des cibles directement repetees. Le triplet d'adn interagissant avec alcr, et ce pour les deux types de cibles, est egalement different, il s'agit de 5'-gcg-3'. Autre originalite, alcr est capable de se fixer sur une demi-cible et forme deux complexes avec une cible palindromique correspondant a la fixation independante de deux molecules de proteine, alors qu'un seul complexe est forme avec une cible directement repetee. Dans ce dernier cas, la moitie 3' de la cible est preferentiellement contactee correspondant a la fixation d'une seule molecule d'alcr. Une approche structurale d'analyse de l'environnement des deux atomes de zinc (exafs, xanes) a permis de mesurer les distances entre ces atomes de zinc (3,16a) et entre les atomes de zinc et de soufre (2,34a). La structure tridimensionnelle du motif a zinc a ete resolue par une analyse rmn et montre la presence d'helices alpha dans les zones supposees interagir avec l'adn. Sur la base de ces donnees biochimiques et structurales un modele d'interaction entre le motif a zinc d'alcr et une cible adn a ete etabli. Le role physiologique des divers domaines autres que le motif a zinc d'alcr est en cours d'etude et plus particulierement celui de la sequence amino-terminale. Ces etudes sont une premiere approche des relations structure-fonction de l'activateur transcriptionnel alcr