Abstract FR:

La recombinaison dite illegitime entre de courtes repetitions directes (<20 pb) peut provoquer la deletion du fragment d'adn present entre ces repetitions (insert) et de l'une des repetitions. La frequence de tels evenements de recombinaison est sensible a de nombreux facteurs genetiques et structuraux. Nous avons construit, chez bacillus subtilis, un systeme plasmidique derive de pam1 qui se replique par un mecanisme theta, et qui porte des repetitions directes de 18 pb separees par un insert de taille variable. Nous avons etudie l'effet sur la recombinaison illegitime entre ces repetitions de deux parametres structuraux: la taille et la transcription de l'insert. Nous avons, dans le premier chapitre, mis en evidence une decroissance continue, d'une amplitude de 1000 fois, de la frequence de recombinaison en fonction de l'augmentation de la taille du fragment d'adn place entre les repetitions et cela sur une large gamme de tailles: de 15 a 2000 pb. L'existence de deux mecanismes de recombinaison, l'un pour des inserts de moins de 300 pb et l'autre pour des inserts de plus grandes tailles, est discutee a la fin de cette these. Le changement du type de mecanisme implique dans la recombinaison pourrait etre lie a des constantes physiques intrinseques a la molecule d'adn. Dans une deuxieme partie, nous avons montre que la presence d'une activite promotrice entre les repetitions de 18 pb pouvait, dans une orientation, diminuer de pres de 1000 fois la frequence de recombinaison illegitime. Deux hypotheses pouvant expliquer l'activite inhibitrice de la transcription sur la recombinaison sont discutees: 1) les modifications de topologie induites par la transcription pourraient soit diminuer la reactivite des repetitions soit les eloigner; 2) la machinerie de transcription pourrait directement detruire les intermediaires de recombinaison