Analyse conformationnelle de glucides par rmn et modelisation moleculaire. Interpretation quantitative des phenomenes de relaxation
Institution:
Paris 6Disciplines:
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Dans les processus biologiques, la conformation et la flexibilite des molecules jouent un role important. Au cours de ce travail, l'analyse conformationnelle et dynamique de plusieurs glucides a ete realisee par les techniques conjointes de la rmn et de la modelisation moleculaire. Une etude de l'influence des mouvements internes sur les parametres de relaxation proton et carbone a montre la sensibilite de ces grandeurs vis a vis des mobilites locales, selon leur nature. L'analyse d'un ensemble important de donnees a mis en evidence la flexibilite d'oligosaccharides de tailles variees (degre de polymerisation 2 a 5). Une etude d'oligo- et polysaccharides de la famille des xyloglucanes, isoles de graines de cyclamen, a permis d'etablir la structure primaire de ces glucides, constituee de la repetition du motif glu#4xyl#3gal. L'analyse des parametres de relaxation carbone a caracterise la mobilite des chaines laterales de ces hemicelluloses. La simulation des constantes de couplage pour un grand nombre de formes de cycles pyranoses et l'evaluation, par mecanique moleculaire, de la stabilite des geometries correspondantes, a permis d'etablir la configuration du centre anomerique et les formes originales adoptees par des ions nitriliums, intermediaires d'une reaction de glycosylation selective. Finalement, un derive du lactose a servi a evaluer trois champs de forces differents et une nouvelle methode de recherche conformationnelle heuristique. L'analyse quantitative des parametres rmn, en utilisant, en outre, la methode dite de la matrice de relaxation complete, a demontre l'existence de multiples conformeres en solution et a etabli que, en contradiction avec le modele generalement admis, les mouvements internes n'etaient pas assez rapides pour negliger leur contribution a la densite spectrale. L'ensemble des travaux realises a fourni de nombreux renseignements sur la dynamique interne des glucides, permettant ainsi de progresser dans l'analyse quantitative des donnees de ces molecules flexibles