thesis

Etude structurale et fonctionnelle du pseudogene rabique (psi) : implications dans la replication et l'epidemiologie du virus de la rage

Defense date:

Jan. 1, 1991

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Institution:

Paris 6

Disciplines:

Directors:

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Abstract FR:

Le genome du virus de la rage est un arn negatif non segmente. Entre les cistrons g (glycoproteines) et l (polymerase) il possede un gene remanent (pseudogene psi de 423 bases qui est non codant mais conserve d'un isolat a l'autre. Une etude structurale et fonctionnelle du pseudogene psi a ete effectuee. La premiere a montre qu'il represente la region la plus variable du genome. La seconde, qu'il semble implique dans la regulation de la transcription. Il peut etre en effet le siege d'un phenomene inedit de terminaison alternative de la transcription retrouve aussi entre les cistrons m2 (proteine de matrice) et g. Ce mecanisme permet de moduler l'expression du gene distal au cours de l'infection et pourrait etre sous la dependance d'un facteur regulateur d'origine virale ou tissulaire. Ces resultats invitent a etudier une possible explication de la neurotropie rabique au plan transcriptionnel. Nous avons aussi mis au point une technique simple et rapide d'amplification par p. C. R. Des isolats sauvages de lyssavirus adaptee au diagnostic comme au typage. Pour le diagnostic le gene de la nucleoproteine, tres conserve, est amplifie. Pour le typage, la variabilite du pseudogene psi est mise a profit. Les differences s'apprecient, soit par polymorphisme de restriction, soit par sequencage. Cet outil performant d'epidemiologie a ete eprouve dans une etude des isolats francais. Ils sont tres homogenes mais divergent des souches vaccinales. Une correlation existe entre sequence et provenance geographique. Ceci nous encourage a etendre nos etudes d'epidemiologie moleculaire au niveau mondial