Triple-hélices d’ADN inter et intramoléculaires : extension des séquences cibles et rôles biologiques
Institution:
Paris 6Disciplines:
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Un oligonucléotide de synthèse peut reconnaitre spécifiquement un enchainement de bases puriques d'une double-hélice oligopurine/oligopyrimidine et former ainsi une triple-hélice locale, base moléculaire de la stratégie antigène destinée à contrôler artificiellement l'expression d'un gène choisi. Afin d'élargir la panoplie des séquences cibles a des double-hélices comportant une séquence oligopurine suivie sur le même brin d'une séquence oligopyrimidine, nous avons conçu un oligonucléotide saut de brins pouvant s'apparier alternativement avec les deux brins oligopurines. La stabilité de la triple-hélice avec l'oligonucléotide saut de brins peut être augmentée sans perte de sélectivité (i) par addition de dérivés benzoepyridoindoles (bepi), ligands spécifiques des triple-hélices, (ii) par optimisation, sur l'oligonucléotide saut de brins, du nombre et de la nature des nucléotides permettant la traversée du grand sillon. Dans des plasmides surenroulés négativement, des sequences oligopurine?oligopyrimidine possédant une symétrie en miroir sont susceptibles de se replier en une conformation particulière de l'Adn, l'Adn-h comprenant une région en triple-hélice intramoléculaire. Nous avons montré qu'il est possible d'étendre le nombre de séquences susceptibles de former l'Adn-h a des séquences non oligopurine?oligopyrimidine et ne possédant pas de symétrie en miroir. Cette nouvelle conformation de l'adn comporte une triple-hélice intramoléculaire saut de brins. Le rôle biologique de l'adn-h reste à déterminer. Nous avons montré qu'une séquence oligopurine?oligopyrimidine en miroir, insérée entre le gène Bla (conférant à l'hôte la résistance à l'ampicilline) et son promoteur peut adopter une conformation adn-h in vitro sur le plasmide surenroulé négativement. In vivo, dans des bactéries e. Coli en présence d'ampicilline, la séquence en miroir peut réguler la transcription du gène Bla mais pas la réplication plasmidique. Afin de survivre en présence d'ampicilline, certaines bactéries peuvent développer des mécanismes permettant d'adapter leur physiologie à la présence de séquences d'Adn susceptibles, en changeant de conformation, d'interférer avec l'expression du gène Bla, processus biochimique vital en présence de l'antibiotique.