Organisation compositionnelle du genome nucleaire des plantes
Institution:
Paris 7Disciplines:
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Abstract FR:
L'etude de l'organisation moleculaire du genome nucleaire des plantes superieures a ete developpee, dans cette these, selon trois volets principaux. Dans le premier volet (articles i, ii et iii) la structure en isochores du genome vegetal a ete etablie. Ainsi nous avons demontre: a) l'heterogeneite de la composition en bases des fragments d'adn qui constituent les genomes vegetaux etudies, ce qui definit leurs plans de composition specifiques; b) la difference des plans compositionnels entre la famille des gramineae et les autres dicotyledones et monocotyledones analysees: c) la correlation entre composition en bases d'un gene donne et sa strategie d'utilisation des codons; d) l'existence de correlations compositionnelles entre genes (exons, positions dans les codons, introns) et grands fragments d'adn qui les contiennent. Dans le deuxieme volet (article iv), l'etude de la distribution de la methylation dans les genomes de cinq angiospermes, fractionnes selon la composition en bases, nous a mene a demontrer l'existence d'un gradient croissant de methylation des regions pauvres en gc aux regions riches en gc. Le gradient de methylation est different dans les differentes especes etudiees et il est vraisemblablement lie a l'organisation interne de sequence, propre a chaque genome. Le troisieme volet (article v) a conduit a la demonstration de l'existence d'une bimodalite compositionnelle a l'interieur du genome du tabac. Cette bimodalite est due a la nature tetraploide de ce genome et notamment a la difference de la composition en bases des deux subgenomes parentaux, n. Sylvestris et n. Tomentosiformis, qui ont coexiste dans le meme noyau, pendant une certaine periode evolutive, sans donner lieu a des phenomenes de recombinaison significatifs