Adn circulaires extrachromosomiques dans les embryons de drosophila melanogaster : caracterisation d'une nouvelle famille de sequences repetees en tandem
Institution:
Clermont-Ferrand 2Disciplines:
Directors:
Abstract EN:
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Abstract FR:
Le travail de cette these porte sur les sequences d'adn existant sous forme circulaire dans les embryons de drosophila melanogaster. Une banque d'adn genomique a ete criblee par une sonde constituee d'adn circulaires et une sonde adn genomique ce qui a permis de reveler que les familles majeures de sequences sont constituees de sequences repetees. En plus des familles deja connues, de nouvelles sequences ont pu etre identifiees. L'une d'entre elles, sc1, inconnue jusqu'alors, presente la particularite d'etre sur-representee dans les adn circulaires par rapport a sa representation dans le genome. Cette sequence est constituee de repetitions d'une unite de 11 pb dont la sequence consensus 5 actggtc ccgt 3 est riche en g+g (63%). Elle represente environ 0,06% du genome haploide et elle est localisee essentiellement dans l'heterochromatine pericentrometrique. Elle est organisee preferentiellement sous forme de grands blocs de 20 a 50 kb, qui sont associees a d'autres sequences hautement repetees. Quelques petits blocs de 2 a 15 kb peuvent etre detectes, associes principalement a des sequences repetees dispersees. L'une des hypotheses pour expliquer la sur-representation de sc1 dans la population suppose qu'elle soit capable de replication autonome extrachromosomique. Cependant par un test de replication in vitro, nous avons pu montrer que cette sequence n'avait pas d'activite origine de replication. Une seconde hypothese suppose que sc1 est particulierement sensible aux mecanismes de recombinaison. Nous avons tente de tester l'influence de sc1 sur la recombinaison meiotique mais nous n'avons pu obtenir le materiel biologique necessaire a ce test.