thesis

Etude structurale de la forme rhomboedrique de l'annexine v par diffraction des rayons x

Defense date:

Jan. 1, 1993

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Institution:

Paris 11

Disciplines:

Directors:

Abstract EN:

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Abstract FR:

Nous avons tente de resoudre la structure de l'annexine v par la methode de diffraction anomale multi-longueurs d'onde (mad). L'annexine v est une proteine de 36 kda possedant plusieurs sites de fixation du calcium. Ces sites ont ete substitues par un lanthanide (yb) de rayon ionique similaire. Au voisinage de son seuil d'absorption liii, les composantes anomales (f et f ) subissent d'importantes variations dont il est possible de tirer parti pour le calcul des phases des reflexions de bragg. Une experience d'absorption x a permis de determiner la variation de f et f en fonction de la longueur d'onde. L'enregistrement des jeux de donnees mad a necessite 5 cristaux, ce qui a conduit a des jeux de qualite variables et a l'impossibilite de localiser les diffuseurs anomaux dans les cartes de patterson. La structure cristalline de la forme calciee a alors ete determinee a partir d'une structure connue de l'annexine v huber et coll. (1990), embo j. , 9, 3867, et ce modele a ete utilise pour localiser les sites substitues par l'yb. La structure partielle est tres dispersee (6 sites) et peu substituee (<40%), ce qui explique en partie pourquoi les cartes de patterson etaient ininterpretables. Les deux structures (ca et yb) de l'annexine v ont ete affinees en utilisant les programmes xplor, prolsq et o. Les facteurs r obtenus apres affinement sont resp. 16,7 et 16,4%. La procedure du calcul des phases par methode mad a ete reprise en utilisant les positions des yb obtenus apres affinement. Pour les meilleurs jeux de donnees, l'ecart moyen entre les phases mad et les phases modeles est 60