Étude de l'instabilité génétique dans le lymphome follliculaire
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Le lymphome folliculaire (LF) est le plus fréquent des lymphomes B non hodgkiniens indolents. 11 est caractérisé par une dérégulation du gène BCL2, insuffisante à elle seule pour le développement du lymphome. L'acquisition d'anomalies génétiques additionnelles est indispensable à son émergence. Dans le but de mieux caractériser l'instabilité génétique dans le LF, nous avons choisi de travailler sur une cohorte prospective de patients atteints de LF au diagnostic ou en abstention thérapeutique, et de réaliser une étude pangénomique à partir de fractions purifiées B tumorales et non-B correspondant au microenvironnement. A l'aide de technologies haute résolution sur puces à ADN (CGH array et SNP array), nous avons identifié des régions récurrentes d'anomalies du nombre de copies de gènes et de disomie uniparentale. Une analyse associant les données de CGH array et de transcriptome a permis de mettre en évidence l'existence de régions dont les expressions des gènes étaient corrélées entre elles et dépendaient ou non des altérations du nombre de copies. La régulation des gènes situés dans les régions indépendantes doit donc être liée à des mécanismes épigénétiques, notamment aux miRNA comme le suggère notre analyse. Dans notre cohorte, les altérations de la région 1p36. 32 représentaient la plus fréquente des anomalies secondaires. La région minimale délétée délimitée comprenait pour seul gène candidat TNFRSF14, déjà identifié comme gène suppresseur de tumeur. L'étude ciblée de TNFRSF14 dans une cohorte étendue de LF a montré que ce gène était fréquemment altéré, suggérant qu'il s'agit d'un évènement précoce dans la pathogenèse de la maladie pouvant contribuer à sa progression.