Occurence et antibio-résistance des populations d'Escherichia coli et de Pseudomonas du réseau karstique jusqu'au robinet : implication dans la dissémination de la résistance bactérienne aux antibiotiques oar l'eau potable ?
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Abstract EN:
Aquatic environments are places where fecal antibiotic-resistant bacteria, selected in human and animal intestines, can easily meet environmental bacteria, which may also carry resistances. Surface water and groundwater are water resources and could be a path back to humans for antibiotic-resistant bacteria and their related genes. This thesis aims to study the circulation and the antibiotic resistance of two bacterial populations from the water resources to the water tap: Escherichia coli –the fecal contamination indicator- and Pseudomonas –autochthonous aquatic environment bacteria-. Because karsts are vulnerable to rainfall events, this study was carried out in different hydrological conditions. Pseudomonas isolates carrying a similar resistance pattern were observed in the spring water, whatever the hydrological conditions, and in drinking water only during the turbid events. Analysis of the resistance patterns highlighted the presence of two sub-populations with different origins (human and animal) among the resistant E. Coli isolated from the springs, one of which could be used as a sub-surface leaching indicator. In order to study the ability of resistance genes to spread in the different bacterial populations, and then the risks linked to these inputs of bacteria in the water resource, the genetic elements were characterized.
Abstract FR:
Les environnements aquatiques sont un lieu privilégié de rencontre entre les bactéries fécales antibio-résistantes sélectionnées dans les intestins des hommes et des animaux, et les bactéries présentes naturellement dans l’Environnement, qui peuvent également porter des résistances. Les eaux de surface et souterraines constituent la ressource en eau et pourraient constituer une voie de retour à l’homme pour les bactéries antibio-résistantes et les gènes associés. Cette thèse a donc pour but d’étudier la circulation et l’antibio-résistance de deux populations bactériennes de ressources karstiques (Radicatel, 76) au réseau de distribution de l’eau potable : Escherichia coli -témoin de la contamination fécale- et Pseudomonas -bactérie autochtone des environnements aquatiques-. Les karsts étant vulnérables aux évènements de pluie, cette étude a été réalisée dans différentes conditions hydrologiques. Des souches de Pseudomonas présentant un profil de résistance similaire ont été observées dans l’eau des sources, quelques soient les conditions hydrologiques, et dans l’eau potable uniquement lors d’évènements turbides. L’analyse des profils de résistance a en revanche mis en évidence la présence de deux sous-populations d’origine différente (humaine et animale) parmi les souches résistantes d’E. Coli isolées des sources, dont une pourrait même être utilisée comme marqueur des processus de lessivage des sols. Dans le but d’étudier la capacité de propagation des gènes de résistance dans différentes populations bactériennes et, donc, les risques représentés par ces apports de bactéries dans la ressource en eau, une caractérisation de supports génétiques a été initiée.