thesis

Activateurs précoces du processus de trans-traduction : rôle de la protéine ribosomique S1 et recherche d’une activité ribonucléase liée au ribosome

Defense date:

Jan. 1, 2008

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Institution:

Rennes 1

Disciplines:

Authors:

Abstract EN:

When bacterial translation stalls on a truncated messenger RNA (mRNA), ribosomes are released by process called trans-translation. This system requires a particular ribonucleic acid: transfer-messenger RNA (tmRNA), acting in concert with several protein partners including ribosomal protein S1. In vitro studies showed that S1 is essential to the resume of translation on the internal open reading frame of tmRNA. Accordingly, any variation of the expression level of S1 in vivo is harmful to the process. Trans-translation occurs sometimes on non truncated mRNAs, which are subsequently cleaved into the ribosomal A site to trigger the process. The factor responsible of the cleavage is still unknown. In order to find out the way these mRNA are cleaved, an in vivo system allowing purification of stalled ribosomes on non truncated mRNAs was set up. No endoribonuclease could be identified, nevertheless an exonucleotytic activity was observed. A new model of trans-translation intervention was established.

Abstract FR:

Lorsque la traduction bactérienne est bloquée sur un ARN messager (ARNm) incomplet, les ribosomes sont libérés grâce à un mécanisme appelé trans-traduction. Ce système requiert le concours de l?ARN transfert-message (ARNtm) qui agit en présence de plusieurs protéines dont la  protéine ribosomique S1. Des études in vitro ont permis d?établir que S1 est essentielle à la traduction du cadre interne de lecture de l?ARNtm et des études in vitro d'observer qu'une variation de son expression était néfaste à ce processus. Dans le cas d'ARNm en cours de traduction, un site de décodage libre est nécessaire au recrutement de la trans-traduction. Le facteur responsable du clivage de l'ARNm dans ce site est encore inconnu. Afin de l'identifier, un système de purification des ribosomes bloqués a été mis au point au laboratoire. Le facteur responsable de cette activité n'a pu être identifié cependant une activité exonucléase a été observée. Un modèle d'intervention de la trans-traduction a été proposé.