thesis

Etudes structurales de la phosphoprotéine du virus de Sendai

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Jan. 1, 2000

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Abstract FR:

Ce travail de these a permis d'explorer la structure de la proteine p du virus de sendai. Cette proteine est le cofacteur de la polymerase qui permet sa fixation sur la matrice d'arn recouvert de la proteine n. Elle est donc un element indispensable a la synthese d'arn par le virus. L'analyse de la sequence primaire de cette proteine a permis la definition de domaines structuraux qui a ete renforcee par une etude par proteolyse limitee. Nous avons etudie la forme generale et la contribution de chacun des domaines a cette forme par chromatographie sur tamis moleculaire et diffusion de rayons x ou de neutrons aux petits angles. Celle-ci s'est revelee tres allongee. Ces domaines ont ete etudies plus en details par pontage chimique, ultra-centrifugation analytique et par un test de dilution de his-tag. Ces experiences ont montre que cette proteine forme des tetrameres tres stables. Une etude par cristallographie aux rayons x a alors ete entreprise sur le domaine de multimerisation. Les premiers cristaux obtenus se sont reveles macles par une macle rare qui a ete etudiee et comprise. Une nouvelle construction, legerement plus courte, nous a permis grace a un derive de mercure et a une experience de dispersion anomale multi-longueur d'onde, de resoudre cette structure. Ce domaine adopte une conformation en homo-tetra-helice super enroulee qui n'avais jamais ete decrite dans le cas d'une proteine naturelle. Une etude par resonance magnetique nucleaire a ete initiee afin d'etudier le domaine de fixation a la nucleocapside. Cette etude nous permettra, en la couplant avec la structure resolue par cristallographie et les etudes de forme et de taille de modeliser l'ensemble du domaine necessaire a l'activite de transcription et ainsi de mieux apprehender les mecanismes d'action et les contacts entre les proteines impliquees dans la synthese d'arn par le virus.