thesis

Inférence du réseau génétique d'Id2 dans les kératinocytes humains par intégration de données génomiques à large échelle

Defense date:

Jan. 1, 2007

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Institution:

Evry-Val d'Essonne

Disciplines:

Biology

Authors:

Directors:

Abstract EN:

We report in the present study the characterization of the genetic regulatory network of Id2, a dominant negative regulator of bHLH, to further understand its role in the control of the proliferation/differentiation balance in human keratinocytes. To identify Id2 gene targets, we first used gene expression profiling in cells exhibiting Id2 overexpression or knock-down. At the same time we screened an siRNA library using an siRNA microarrays approach to characterize Id2 transcriptionnal regulators. These results, with additional phenotypic observations, show that Id2 exert a key role in the control of keratinocyte commitment into differentiation or proliferation. Furthermore, we unravel new functions of Id2 in anaphase promotion and DNA recombination control. Overal, our results alllowed a first description of Id2 genetic regulatory network topology.

Abstract FR:

Dans ce travail nous avons étudié le réseau génétique d'Id2, un régulateur dominant négatif des bHLH, de manière à comprendre son rôle dans le contrôle de l'équilibre entre prolifération et différenciation dans les kératinocytes humains. Nous avons pour cela mis en œuvre une stratégie originale consistant, d'une part à étudier les variations du transcriptome de kératinocytes présentant une surexpression et une extinction d'Id2 de manière à découvrir les gènes qu'elle régule, et d'autre part à cribler les gènes régulateurs de l'expression d'Id2 sur puce à siARN. L'ensemble des résultats, complétés par des mesures phénotypiques, nous ont permis de mettre en évidence le rôle d'Id2 dans l'entrée en différenciation, la régulation de la prolifération, mais aussi dans des fonctions inconnues comme le contrôle de l'anaphase et la réparation des dommages de l'ADN. Enfin, ces résultats nous ont permis plus globalement d'appréhender la topologie du réseau de régulation transcriptionnelle d'Id2.