Phénotypage métabolique des réponses aux stress abiotiques chez Arabidopsis thaliana : analyse fonctionnelle et intégrative du métabolome
Institution:
Rennes 1Disciplines:
Directors:
Abstract EN:
Abiotic stresses (extreme temperatures, salinity, drought) impair plant growth and development and are important agronomic challenges. Understanding stress responses developed by various species contributes to crop improvement and also constitutes an interesting approach of integrated mechanisms operating at different organisation levels in highly regulated ways. Availability of genotypes collections, molecular analysis tools and efficient bioinformatics pave the way to phenotyping of model plants at the genomic scale, in relation with their environment. Metabolmics, defined as unbiaised, nontargeted and exhaustive analysis of metabolites in biological samples, provide new insights into physiological processes like nutrition, biochemical and structural adaptation or cell signalling. Present work is an exploratory, diagnostic and correlative approach of primary metablome in the stress sensitive species Arabidopsis thaliana.
Abstract FR:
Les stress abiotiques (températures extrêmes, salinité, sécheresse) ont un impact négatif sur la croissance et le développement végétal et constituent un défi agronomique majeur. La compréhension des réponses mises en œuvre par différentes espèces de plantes est un volet incontournable de toute stratégie d'amélioration variétale, mais offre aussi un modèle de choix pour l'étude intégrative de mécanismes qui opèrent à différents niveaux d'organisation biologique, selon des modalités hautement régulées. L'abondance de collections de génotypes et le progrès des outils d'analyse moléculaires, couplés à des traitements bioinformatiques performants, ont ouvert la perspective de caractériser la plasticité phénotypique de plantes modèles à l'échelle génomique et dans un contexte environnemental dynamique. La métabolomique en particulier, définie comme l'analyse quantitative non ciblée des métabolites d'un échantillon biologique, accède au cœur de nombreux processus physiologiques tels que la nutrition, l'adaptation biochimique et ultrastructurale ou la signalétique cellulaire. Les travaux réalisés constituent une approche de la physiologie du stress chez l'espèce considérée sensible /Arabidopsis thaliana/, par l'analyse du métabolome primaire dans une perspective exploratoire, diagnostique et corrélative.