Etude d'une nouvelle lectine marine de la palourde blanche : codakia orbicularis:la codakine
Institution:
Antilles-GuyaneDisciplines:
Directors:
Abstract EN:
The White clam, Codakia orbicularis (Linné, 1758), is a tropical bivalve found along the southern coast of the USA up to Brasil, and encompassing the caribbean island. It inhabits the sulphur-containing sediments inherent to phanerogam seagrass beds of theThalassia testudinum type and possesses bacterial chemoautotrophic endosymbionts in its gills. In order to gain a better understanding of the adaptation of this bivalve to its stressful environment, we focused our research study on a predominant protein of 14 kDa, which we named "codakine". We predicted that codakine would be a protein which exhibits special biological characteristics that have allowed it to play an important role in the life of the molluse. We therefore set up a research strategy based on the use of various biochemical and biological techniques in order to isolate and characterise codakine. Codakine cDNA was isolated from a gill cDNA library. We performed bioinformatic analyses, including sequence alignments and predictive modelling on the gene and protein sequences. These analyses show that codakine belong to the C-type lectin family. Affinity chromatography purification of codakine and western blot results have confirmed that codakine is a dimeric mannose binding C-type lectin. Other lectins belonging to the same family,such as DC-SIGN and the macrophage mannose receptor, play a role in cellular recognition and innate immunity. In the light of the results obtained, we hypothesise that codakine exhibits similar properties and plays a role in symbiont acquisition and immmune defenses againts pathogen microorganisms.
Abstract FR:
Codakia orbicularis est retrouvée sur les côtes du sud des états-Unis jusqu'au Brésil en passant par les côtes des îles de la caraïbe, dans les sédiments sableux de phanérogames du type thalassiatestidunum. Elle abrite dans ses branchies des bactéries endosymbiotiqueschimioautotrophes sulfo-axydantes qui lui permettent de vivre dans un milieu à fort teneur en sulfures d'hydrogène. Dans le but d'avoir une meilleure compréhension de l'adaptation de ce bivalve à ces conditions stressantes, nous faisons l'hypothèse que la codakine pourrait être une protéine présentant des caractéristiques biologiques lui permettant de jouer un rôle essentiel dans la vie de ce mollusque. Nous avons donc mis en place une stratégie de recherche basée sur l'utilisation de techniques variées de biochimie ou de biologie moléculaire afin d'isoler et de caractériser codakine. L'ADNc de la codakine a été isolé d'une banque d'ADNc de cellules branchiales. Nous avons effectué des analyses bioinformatiques comprenant des alignements de séquences, des modèles prédictifs sur la séquence du gène et de la protéine. Ces analyses montrent que la codakine appartient à la famille des lectines de type c. Les résultats de la purification de la codakine par chromatographie d'affinité et de Western blot confirment que la codakine est une lectine dimérique de type C spécifique du mannose. Des lectines appartenant à cette même famille telles que le DC-SIGN et le récepteur du mannose de macrophage, jouent un rôle dans la reconnaissance cellulaire et l'immunité innée. Au vu de l'ensemble des résultats obtenus, nous faisons l'hypothèse que la codakine présente des propriétés similaires et joue un rôle dans l'acquisition de bactéries symbiotiques et dans la défense contre les microorganismes pathogènes.