thesis

Organisation et structure des genomes mitochondriaux des algues brunes pylaiella littoralis et laminaria digitata

Defense date:

Jan. 1, 2000

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Institution:

Rennes 1

Disciplines:

Abstract EN:

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Abstract FR:

Deux etudes de genomes mitochondriaux d'algues brunes sont presentees. La 1 e r e concerne celui d'une algue presumee primitive pylaiella littoralis. La 2 n d e est le debut de la comparaison avec celui de laminaria digitata, consideree comme evoluee. Le contexte de ces etudes est decrit : la 1 e r e partie traite des endosymbioses ayant conduit aux mitochondries et aux plastes ; une autre concerne la definition des algues brunes et la 3 e traite des mitochondries et de leur genome. L'adn mitochondrial (adnmt) de p. Littoralis et de l. Digitata consiste en molecules circulaires de 58507 pb et de 36k pb, respectivement. Celui de p. Littoralis contient a la fois des promoteurs de type eubacterien et un gene d'arn polymerase de type phagique. Ce genome code plusieurs genes de proteines ribosomiques, dont rpl31, identifie avant uniquement dans l'adnmt d'un protiste primitif, reclinomonas americana. Il code aussi des introns des groupes iia et iib, avec des orfs multidomaines complets. Le gene nad11 ne comporte que le 1 e r tiers du gene habituel, soit celui des domaines de liaison aux groupements fes, dont l'importance a ete montree pour l'activite de l'enzyme. L'autre partie n'est pas codee dans l'adnmt et n'a pas ete detectee dans l'adn nucleaire. Le gene cox2, lui, comporte une insertion de 1006 aa alors qu'il n'en code lui-meme que 280. L'adnmt de p. Littoralis a conserve plus de caracteres primitifs que ceux des autres eucaryotes tout en ayant plus evolue que celui de r. Americana. Les 60% du genome mitochondrial de l. Digitata qui sont sequences ressemblent etonnamment a celui de p. Littoralis. L'ordre des genes est presque identique et leurs sequences ont de tres fortes homologies. Les principales differences sont l'absence des introns et de la plupart des orfs. Nous avons aussi fait plusieurs comparaisons ponctuelles avec d'autres algues brunes qui pourraient etre un outil utile dans l'etude des relations phylogenetiques de la lignee des algues brunes, encore peu connue.