L'apport du clonage sur bases de donnees en biochimie genetique
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Paris 7Disciplines:
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Le sequencage systematique des genomes modeles et des extremites 5' - des adnc humains (ests), d'une part, et l'emergence de la bio-informatique, d'autre part, ont permis d'instaurer une strategie de clonage sur bases de donnees d'adnc complet, d'obtenir la localisation chromosomique des genes, et d'elucider les mecanismes physiopathologiques par une recherche de mutations chez des patients suspectes d'avoir un defaut genetique apres identification des genes candidats. La possibilite d'utiliser la levure comme un tube a essai et la disponibilite d'un jeu complet d'orfs pour cet organisme eucaryote unicellulaire permettent de progresser rapidement dans la connaissance des fonctions cellulaires chez les eucaryotes superieurs. Nous avons developpe quatre modeles d'utilisation des ressources bio-informatiques comme outils de clonage des genes humains impliques dans les erreurs innees du metabolisme : nous avons ainsi pu identifier le gene humain codant pour la 1 pyrroline 5-carboxylate synthetase dont le deficit est responsable d'un syndrome d'hyperlaxite articulaire et cutanee, d'une cataracte, d'un retard mental et d'une hyperammoniemie avec des concentrations sanguines diminuees en proline, citrulline et ornithine. Nous avons aussi identifie le gene codant pour la sous-unite x du complexe enzymatique de la pyruvate-deshydrogenase dont le deficit correspond a l'absence totale de la proteine chez un groupe d'enfants presentant une nouvelle forme d'acidose lactique neonatale. Enfin, d'autres tentatives de recherche d'homologies nous ont permis de cloner, d'une part, le gene de la 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase (dans le cadre d'une recherche de mutation dans le gene, supposee etre impliquee dans le deficit en coenzyme q) et, d'autre part, un est humain putatif dont la sequence presente une homologie significative dans la region la plus conservee de l'enzyme n-acetyl glutamate synthase.