Abstract FR:

Cre et tre sont des elements de reponse de l'adn sous le controle de l'amp cyclique (cre) et du tpa (tre), et reconnus par des dimeres de proteines bzip (basic leucine zipper). Ils se trouvent respectivement dans la region promotrice de genes ubiquitaires et de protooncogenes (c-jun). Tre est reconnu specifiquement par les oncoproteines jun/fos, mais cre interagit avec les membres jun/fos et atf/creb. Les sequences consensus de cre et de tre sont tres voisines, respectivement d(tgacgtca) 2 et d(tgactca) 2. Il a ete propose que la courbure de l'adn jouait un role essentiel dans la reconnaissance de cre ou de tre par les facteurs bzip. Nous avons determine les conformations de cre et de tre par modelisation moleculaire. Nous avons aussi etudie la structure de cre methyle en cpg, car cre methyle n'est plus reconnu par atf/creb. Nos resultats sont les suivants : - la courbure de cre obtenue par minimisation d'energie sous contraintes de rmn est en desaccord avec les donnees experimentales de la biochimie. Ce desaccord est du au logiciel utilise pour le raffinement de la structure, et particulierement a la prise en compte de l'electrostatique. - la dynamique moleculaire en solvant explicite (amber) donne pour cre et pour tre une structure et une courbure tres proches des donnees experimentales (biochimie et complexes cristallographiques). - la faible difference de courbure entre cre et tre (< 10\) et leurs flexibilites similaires ne permettent pas de rendre compte de la reconnaissance specifique des proteines atf/creb pour cre. - la malleabilite du pas cpg au centre de cre lui permet de s'adapter a gcn4 (proteine de levure) aussi bien que tre, en compensant en partie la presence d'une paire de bases supplementaires au centre de cre. - la methylation de cre reduit sa flexibilite et son adaptabilite aux partenaires bzip, sans doute par un effet conjugue d'encombrement sterique et de repliement de l'adn autour des groupements methyles hydrophobes.