thesis

Optimisation de la technologie des macro-reseaux d'adnc : application a l'etude de l'expression des genes lors de l'apoptose neuronale, de la differentiation cellulaire et du cancer

Defense date:

Jan. 1, 2001

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Institution:

Paris 7

Disciplines:

Directors:

Abstract EN:

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Abstract FR:

Le travail de these presente dans ce memoire avait 2 objectifs : le premier etait de developper la technologie des macro-reseaux d'adnc. Cela m'a conduit a optimiser et a standardiser l'ensemble de la procedure experimentale d'utilisation de la methode. Le second etait d'appliquer la technologie des macro-reseaux d'adnc a l'etude de l'expression des genes. Ceci m'a conduit a etudier plus particulierement un modele d'apoptose neuronale dependante du ceramide. Ainsi, l'utilisation de cibles complexes derivees de cellules pc12 differentiees en neurones sous l'action du ngf et traitees ou non avec un analogue du ceramide a montre une modulation d'expression de 244 genes parmi les 9120 etudies, l'integration des resultats obtenus avec l'ensemble des informations disponibles pour chacun des genes a permis d'identifier 31 genes codant des proteines connues dont 10 impliquees dans la voie de signalisation dependante du ceramide ou du tnf-alpha et 21 impliquees dans la cancerogenese, les maladies neurodegeneratives ou plus largement dans la regulation de la proliferation cellulaire. Par ailleurs, l'etude d'un modele de differentiation des cellules souches hematopoietiques m'a permis d'identifier 11 genes dont l'expression est regulee sous l'action du tpo. Parmi ces genes, celui codant la zyxine a ete choisi pour amorcer une caracterisation fonctionnelle plus approfondie. L'etude d'un modele cellulaire permettant d'apprehender le pouvoir metastasique des cellules tumorales a permis de mettre en evidence 82 genes potentiellement impliques dans ce processus pathologique. Parmi ceux-ci, la caracterisation fonctionnelle des genes codant le cd63 et la chaine d'integrine alpha 3 a montre leur implication dans le controle des capacites d'adherence, d'invasion et de proliferation des cellules tumorales.