Abstract FR:

La topoisomerase ii module les etats topologiques de l'adn. Elle reconnait et clive notamment les structures en epingles a cheveux. Un site preferentiel de coupure en presence d'agents antitumoraux a ete identifie au sein de l'adn de pbr322. Il contient un segment de 19 paires de bases de symetrie inversee-repetee : w d (5agcttatc atc gataagct 3). C d (5agcttatc gat gataagct 3). L'etude rmn a montre que chacun des brins pris separement adoptait une structure en epingles a cheveux avec une tige a huit/dix paires de bases et une boucle a trois/un residu. Au cours de ce travail de these nous avons analyse l'impact de certains parametres structuraux sur la stabilite et la conformation des boucles a l'aide des spectroscopies uv, de dichroisme circulaire, et de rmn utilisant comme modele simple brin d'adn d (5agcttatc xxx gataagct 3), ou xxx = gac, cag, at(l)c (thymidine centrale de configuration l). Nous avons evalue l'equilibre critique (dependant de la concentration en oligonucleotides) entre la forme en epingles a cheveux et la forme en duplex par la mesure des coefficients de diffusion translationnelle. Ceux-ci indiquent qu'aux concentrations de la rmn (mm) les adns contenant gac et at(l)c se replient en epingles a cheveux. Tandis que l'oligonucleotide cag forme un duplex avec un mesappariemment a. A en son centre. La modelisation montre que : (1) gac adopte une boucle a residu unique fermee par une paire de bases watson-crick distordue totalement atypique longtemps consideree comme steriquement impossible ; (2) at(l)c est hautement flexible ce qui s'explique par l'abolition du mesappariement a. C caracterisant atc. Une simulation de dynamique moleculaire de 5 ns en eau et ions explicites sur le duplex cag a revele une dissymetrie de mouvements autour du mesappariement a. A central mais dans ce cas particulier d'autres simulations sont necessaires pour confirmer cette propriete.