Abstract FR:

Nous avons initialement mene une etude theorique du developpement de la variabilite virale chez l'individu infecte par le virus d'immunodeficience humain (hiv), en essayant a l'aide de modeles mathematiques d'associer les observations experimentales a des mecanismes possibles d'apparition de la diversite virale. Cette etude est detaillee dans le premier chapitre. Il nous a cependant paru primordial de valoriser l'accueil dans une unite hospitaliere, au travers d'analyses plus appliquees de la diversite du vih. Dans le cadre de l'etude d'une suspicion de transmission atypique du vih en milieu clinique, commanditee par la ddass de seine saint denis, nous avons aborde le probleme de la parente entre virus par le biais de la phylogenie moleculaire. Ce type d'etude de transmission nous paraissant amene a se banaliser dans l'avenir, nous en discutons les modalites, les possibilites et les contraintes dans le deuxieme chapitre, en utilisant notre etude comme exemple pratique. Enfin, la resistance aux drogues antiretrovirales est une consequence de plus en plus importante de la plasticite genomique du vih. L'etude genotypique de cette resistance s'est fortement developpee au cours des trois dernieres annees. Nous proposons dans le troisieme chapitre les bases d'une formalisation des donnees sur la resistance, qui nous a permis de developper un programme automatisant de maniere souple le processus d'analyse des sequences virale. Ceci permet de plus d'envisager a terme un systeme de gestion de donnees specifique de cette problematique, qui apporterait une aide non negligeable a l'etude statistique des correlations mutation/resistance, entre autres.