Caracterisation du centre d'inactivation du chromosome x : cartographie physique comparee et analyse fonctionnelle par transgenese de yacs
Institution:
Paris 6Disciplines:
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L'inactivation du chromosome x, processus de compensation de dose rencontre chez les mammiferes, consiste en une extinction transcriptionnelle de la plupart des genes de l'un des deux chromosomes x au hasard chez la femelle. Sa mise en place requiert la presence en cis du centre d'inactivation, xic (x inactivation center). Le gene xist (x inactive specific transcript) localise dans le xic produit un grand arn non codant couvrant entierement le chromosome x inactif dans les tissus somatiques de la femelle. Ce gene est essentiel a l'initiation de l'inactivation. Neanmoins, une deletion de 65kb en 6 de xist a egalement suggere l'importante fonction de sequences avales dans la regulation de l'expression de xist. L'organisation de la region xic semble complexe puisque l'orientation du gene xist et de deux genes situes en 3 est inversee par rapport a l'ordre general de la region de syntenie entre l'homme et la souris. Le premier objectif de ce travail a ete l'assemblage d'un contig de yacs couvrant environ 2 mb autour de xist. La presence sur le contig du gene xpct (x-linked pest-containing transmembrane transporter) et la comparaison avec la situation deja connue chez l'homme, a permis de montrer que la region xpct-xist a subi des remaniements complexes au cours de l'evolution. Cette analyse structurale a conduit a discuter la definition de la region candidate pour le xic murin et les limites de l'approche de cartographie comparee dans l'etude des loci complexes. La deuxieme partie de ce travail a consiste en une etude fonctionnelle, par deletion et transgenese de yacs, dans des cellules souches embryonnaires murines, d'une sequence candidate potentiellement impliquee dans les fonctions du xic. L'ensemble des resultats obtenus a permis d'etablir que dxpas34, element repete situe 15 kb en 3 de xist, joue un role fondamental dans la regulation de l'activite transcriptionnelle d'une region de 50 kb incluant xist, et dans les processus de comptage et/ou de choix, lies a l'initiation de l'inactivation. Le role de cet element dans la regulation de la structure chromatinienne du locus xist ainsi que dans les fonctions d'inactivation in vivo, a ete aborde par immunoprecipitation de la chromatine et creation de souris chimeres.