thesis

Identification de qtl pour des caracteres adaptatifs a la secheresse chez arabidopsis thaliana

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Jan. 1, 2001

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La contrainte hydrique joue un role majeur dans les pertes de rendement observees chez les plantes cultivees. Une approche quantitative est necessaire pour apprehender les bases moleculaires et genetiques des reponses adaptatives des plantes a la secheresse, qui sont le plus souvent de nature polygenique. Arabidopsis thaliana, en raison de ses nombreux avantages (genome sequence, petite taille de la plante, rapidite du cycle de vie), est un modele d'etude ideal. Le but de ce travail etait d'identifier des qtl pour des caracteres adaptatifs a la secheresse chez arabidopsis thaliana. Les recherches ont porte sur les lignees landsberg erecta (ler) et columbia (col), qui presentent des strategies d'adaptation a la contrainte hydrique contrastees (respectivement l'esquive et la tolerance), leurs hybrides f1, et 100 lignees recombinantes (lr) issues du croisement de ces deux accessions. Les plantes ont ete cultivees en conditions controlees de secheresse progressive ou d'hydratation reguliere, en microphytotron. Vingt-et-un caracteres morphologiques, physiologiques et biochimiques ont ete mesures. Les resultats obtenus ont permis de caracteriser tres precisement les deux strategies d'adaptation a la secheresse de ler et col en photoperiode courte (8h), et de mettre en evidence une heridite paternelle chez les f1 pour la senescence des feuilles et l'allocation de biomasse. Ler et col ont montre par ailleurs une reponse differentielle au changement de photoperiode. Chez col, la strategie d'esquive ou de tolerance est controlee par la duree d'eclairement, alors que pour ler seule l'esquive est utilisee. La mesure des caracteres adaptatifs a la secheresse chez les 100 lr en photoperiode courte a permis d'identifier de nombreux qtl, generalistes ou specifiques de l'un des deux traitements. Les correlations observees mettent en evidence une structuration des caracteres en deux groupes distincts d'esquive et de tolerance. Les colocalisations multiples de qtl au sein des deux strategies suggerent que quelques qtl generalistes a effets pleiotropes, et de r 2 eleves, seraient responsables de l'essentiel de cette structuration. Des colocalisations multiples ont ete detectees entre des qtl et des genes de biosynthese (anthocyanes) et de signalisation (ethylene, aba et auxine). En particulier, les genes ab11 et ab12 ont ete retenus comme des candidats interessants, qui auraient un effet pleiotrope sur plusieurs caracteres adaptatifs, et s'exprimeraient specifiquement en reponse au deficit hydrique.