thesis

Plasmides de rhizobia nodulant le haricot (Phaseolus vulgaris L. ) : transfert de plasmides symbiotiques, diversité de séquences repC de réplication

Defense date:

Jan. 1, 2000

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Institution:

Dijon

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Abstract FR:

L'objectif de cette étude était d'estimer l'effet potentiel des transferts horizontaux de plasmides sur la structure des populations naturelles de rhizobium symbiotes du haricot, et d'identifier des marqueurs permettant de caractériser et de suivre les plasmides dans ces populations. Douze plasmides symbiotiques (psyms) transférables ont été identifies au sein d'un échantillon d'isolats symbiotes du haricot. Cinq de ces psyms appartenant à cinq espèces ont été marques avec le transposon tn5 et croises avec une trentaine de souches réceptrices de notre échantillon. Des transferts ont été observés à des fréquences variant de 10 5 à 2 10 9. L'ensemble de ces transferts menait a des associations psym-espèce plus diverses que celles caractérisées au sein de populations naturelles. L'analyse des profils plasmidiques de nombreux transconjugants a permis d'observer l'existence d'interactions entre plasmides menant à des réarrangements de plasmides transférés et/ou de plasmides résidents des souches réceptrices ainsi qu'à des cotransferts de plasmides des souches donatrices. L'ensemble de ces résultats indique l'existence d'un potentiel de transfert important de gènes plasmidiques entre rhizobia symbiotes du haricot. Afin de caracteriser les plasmides de notre échantillon, nous avons étudié par pcr/rflp la diversité de séquences repC d'origines de réplication de plasmides amplifiées par des amorces rc1/rc3. Nous avons pu confirmer la large distribution de ces séquences au sein de rhizobia symbiotes du haricot et observer des séquences repC présentant des caractéristiques communes dans des souches d'espèces différentes, suggérant la possibilité de transferts horizontaux de gènes de réplication entre rhizobia symbiotes du haricot. Une étude phylogénétique de 12 séquences repC caractérisées dans notre échantillon a permis d'identifier trois groupes repC nouveaux que des amorces spécifiques permettent de détecter et de suivre au sein des populations naturelles.