Abstract FR:

La biodégradation accélérée (bda) des pesticides est l'une des conséquences pratiques majeures de la structure et de l'évolution des populations microbiennes impliquées dans la minéralisation des produits phytosanitaires. L'un des premiers pesticides ayant fait l'objet d'une bda a été le carbofuran, un insecticide de la famille des n-méthylcarbamates. Les objectifs principaux de cette thèse étaient d'une part de caractériser les populations microbiennes telluriques impliquées dans la dégradation du carbofuran et d'autre part de décrire les flux potentiels d'un gène particulier intervenant dans le catabolisme de ce pesticide, le gène mcd (méthylcarbamate dégradation). Au total, plus de 128 micro-organismes dégradant le carbofuran ont été caractérisés génétiquement par analyse de leur adnr 16s, de leur région intergénique 16s-23s et par séquençage partiel. Par ailleurs, les ribotypes 16s de 68 isolats dégradants, provenant de parcelles agronomiques ayant reçu des programmes de traitements différents, ont également été déterminés. Nos résultats confirment que la grande diversité des populations bactériennes dégradant le carbofuran est certainement sous-estimée. Néanmoins, l'impact des concentrations ou des traitements pesticides sur la nature des souches dégradantes et sur la diversité des groupes microbiens impliques n'a pu être établi. Enfin, après avoir vérifié que le gène mcd était transférable in vitro depuis des isolats dégradant le carbofuran vers une souche receveuse (agrobacterium tumefaciens, 9023), des systèmes plus complexes (microcosmes) ont été utilises pour étudier le transfert. Il s'avère que des transferts du gène mcd ont été observes, soit entre les souches introduites dans les échantillons de sol, soit de la population indigène vers la souche receveuse inoculée. Par ailleurs, certains résultats laissent supposer que des transferts ont potentiellement eu lieu depuis les souches donneuses vers la population indigène.