Eco-épidémiologie des leishmanioses cutanées en Guyane française
Institution:
Antilles-GuyaneDisciplines:
Directors:
Abstract EN:
Overall, this thesis aims at reactualizing and improving ecological and epidemiological knowledge about cutaneous leishmaniases in French Guiana by using new and adapted molecular tools. Thus, it took up the challenge of an integrated molecular eco-epidemiological approach. A molecular technique (PCR-RFLP) for the detection and the identification of New World Leishmania species was first designed for diagnosis and large-scale epidemiological studies. Parallely, cultures in synthetic medium were carried out for the improvement of routine diagnosis. A strict monitoring of the cutaneous leishmaniasis cases of French Guiana was also developped. Then, the new molecular method was applied to samples from Guianan patients within a large-scale eco-epidemiological study of the Leishmania parasites polymorphism. The actualization of the specific incidence was done and we observed the correlation between the different parasite genotypes and some clinical and epidemiological parameters. Some sand fly and mammal capture sessions confirmed the adaptability of the Nyssomyia sand flies to anthropized ecotopes, proved the absence of implication of Chiroptera in the Guianan pathogenic complexes, and led to the first observations in French Guiana of canine visceral leishmaniases due to L. Infantum imported from Europe. Finally, an integration of molecular, ecological, epidemiological, clinical, geographical, demographic and social data was given.
Abstract FR:
Cette thèse répond globalement aux besoins de réactualiser et d'améliorer les connaissances écologiques et épidémiologiques au sujet des leishmanioses cutanées de Guyane par l'apport de techniques de biologie moléculaire spécialement adaptées, en s'inscrivant dans une approche éco-épidémiologique moléculaire intégrée. La mise au point d'une technique moléculaire de détection et d'identification des Leishmania du Nouveau Monde par PCR-RFLP, adaptée pour le diagnostic et les études épidémiologiques à grande échelle, a tout d'abord été réalisée. En parallèle, une amélioration du diagnostic de routine par culture en milieu synthétique et un développement de la surveillance des cas de leishmaniose cutanée guyanais ont également été menés. Puis, cette nouvelle méthode moléculaire a été mise en application sur des échantillons prélevés chez des patients guyanais, conduisant à une étude éco-épidémiologique du polymorphisme des Leishmania, et mettant en évidence une corrélation entre le génotype des parasites, leur origine géographique et la présentation clinique. Une actualisation du taux d'incidence des différentes espèces de Leishmania endémiques en Guyane a été réalisée par la même occasion. Des missions de captures de phlébotomes et de mammifères ont également été menées. Trois résultats significatifs ont été obtenus. Le premier est une confirmation de l'adaptation des phlébotomes du sous-genre Nyssomyia aux milieux secondarisés par anthropisation. Le second est l'absence d'implication des Chiroptères dans les cycles parasitaires des Leishmania en Guyane. Le troisième est la mise en évidence d'un risque d'importation des formes viscérales exemplifié pour la première fois en Guyane par plusieurs cas de leishmanioses viscérales canines à L. Infantum importée d'Europe. Dans un dernier temps, une intégration des données moléculaires, écologiques, épidémiologiques, cliniques, géographiques, démographiques et sociales est proposée.