Abstract FR:

Depuis la reconnaissance des rôles biologiques des sucres de nombreuses études expérimentales ont portes sur leurs structures. La difficulté à obtenir expérimentalement une structure de sucre a fait de la modélisation moléculaire une des possibilités les plus attrayantes pour l'obtention de conformations de sucres. Le champ de forces spectroscopique spasiba élaboré au laboratoire devait se doter de paramètres relatifs aux sucres. Une base de données concernant les fonctions chimiques éther, alcool et acétal est mise au point grâce aux résultats de spectroscopie de vibration et aux calculs ab initio. Les paramètres obtenus complètent ainsi la base de données des fonctions chimiques élémentaires et constitue le point de départ de la construction d'une base de paramètres relative aux sucres. Les paramètres ainsi obtenus peuvent servir d'outil d'étude de la structure des sucres ainsi que de leur comportement dynamique. Ces paramètres sont d'ailleurs testes lors d'une simulation de dynamique moléculaire sur un modelé de glycoprotéine hydratée représentant un ensemble de 4000 atomes et pour un temps de simulation de 400 picosecondes. Les résultats de la simulation sont en accord avec les données expérimentales disponibles, toutefois il s'avère nécessaire de perfectionner le modelé de la liaison glycosidique.