thesis

Etude structurale de l'endoglucanase A de Clostridium cellulolyticum

Defense date:

Jan. 1, 1996

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Institution:

Aix-Marseille 2

Disciplines:

Directors:

Abstract EN:

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Abstract FR:

Les cellulases sont des glycosyle hydrolases impliquees dans les coupures des liaisons beta-1,4 des chaines glycosidiques de la cellulose. L'endoglucanase a, appelee celcca, est un composant du systeme cellulolytique de clostridium cellulolyticum. Le domaine catalytique de celcca est classe dans la famille 5 des glycosyle hydrolases. Les enzymes de cette famille coupent les liaisons glycosidiques avec retention de la configuration du carbone anomerique. La structure tridimensionnelle du domaine catalytique de celcca a ete determinee a la resolution de 1. 6 angstroms, en utilisant la methode du remplacement isomorphe multiple et le signal anomal d'un derive mercure. Celcca a une topologie de repliement de type tonneau (alpha/beta)8 semblable a celle observee pour la triose phosphate isomerase. Le site catalytique se presente sous la forme d'un sillon qui traverse la surface de la molecule cote carboxy-terminale du tonneau beta. Les deux glutamates catalytiques, impliques dans le mecanisme de catalyse acide/base, sont situes de part et d'autre de ce sillon. Leurs groupements carboxyliques sont separes par une distance de 5. 5 angstroms correspondant a l'espacement caracteristique des enzymes procedant par retention de configuration. L'analyse structurale du site catalytique, en correlation avec les etudes de mutagenese dirigee et des comparaisons structurales, a permis d'attribuer un role a huit residus conserves dans la famille 5 et d'expliquer l'affinite de celcca pour les hexa-glucides. La structure de celcca presente de fortes similitudes structurales avec des glycosyle hydrolases appartenant aux familles 1, 2, 5, 10 et 17. Les membres de ces differentes familles possedent un repliement tertiaire de type (alpha/beta)8, des residus catalytiques similaires et procedent par retention de configuration. Ceci suggere une evolution divergente a partir d'un ancetre commun pour ces enzymes qui ont acquis de nouvelles specificites de substrat au cours de l'evolution