Méthodes de détection de gènes majeurs : application aux animaux domestiques
Institution:
Paris 11Disciplines:
Directors:
Abstract EN:
Statistical tests have been proposed for identification of major genes from data collected in non-experimental populations, in particular in human populations. These methods are compared on their statistical properties (power, level, robustness) and their speed (computation time). Adaptations are proposed for livestock studies. The comparisons are realised using large scale simulations of the test statistics distributions under different hypotheses concerning existence and characteristics of the major gene. The methods are classified in three groups: fast methods used as indicators of major gene segregation, segregation analysis, and analysis of complex pedigrees. All these tests are applied to different data sets concerning two male composite lines of pigs and an experimental flock of goats. The results show segregation of major genes on technological pork quality and lean percentage of pigs, as well as on milk flow of goats.
Abstract FR:
Des tests statistiques ont été proposés pour mettre en évidence des gènes à effet majeur à partir de données recueillies sur des populations non expérimentales, notamment sur des populations humaines. Ces méthodes sont comparées sur le plan de leurs qualités statistiques (puissance, niveau, robustesse) et de leur facilité d'utilisation (temps de calcul). Des adaptations sont proposées pour l'étude des populations d'animaux domestiques. Les comparaisons sont réalisées à l'aide de simulations à grande échelle des distributions des statistiques de test sous différentes hypothèses relatives à la présence et à la qualité du gène à effet majeur. Les méthodes sont regroupées en trois catégories : méthodes rapides pouvant servir d'indicateurs de la présence d'un gène majeur, analyse de ségrégation, analyse de pedigrees complexes. Tous ces tests sont appliqués à différentes mesures concernant deux lignées mâles synthétiques de porcs et un troupeau expérimental de chèvres. Les résultats indiquent la ségrégation de gènes à effet majeur sur la qualité technologique de la viande et le taux de muscle des porcs, ainsi que sur le débit de traite des chèvres.