thesis

Etude de la prévalence de Cryptosporidium spp., Giardia duodenalis et Toxoplasma gondii dans l'eau et dans certains végétaux consommés à Marrakech, Maroc.

Defense date:

Dec. 11, 2020

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Institution:

Reims

Disciplines:

Authors:

Abstract EN:

The parasitic contamination of humans presents a major public health issue. It is directly or indirectly attributed to the consumption of contaminated water and / or food. In Morocco, the current state of epidemiological knowledge on the transmission of these parasites shows gaps, which need to be addressed in order to establish adequate and effective control measures for food safety.In this context, we have conducted an exploratory study in Marrakech during the year 2017 to assess the contamination of five vegetables (carrot, coriander, lettuce, parsley and radish) with Cryptosporidium spp., Giardia duodenalis and Toxoplasma gondii. The detection of the three parasitic forms was performed using microscopy (modified Ziehl-Neelsen staining), immunochromatography and qPCR. The qPCR have revealed an overall contamination rate of 21,21% (28/132), with 22 positive for T. gondii, 6 for G. duodenalis and none for Cryptosporidium spp. On the other hand, this latter was detected in 4 samples by microscopy. However, the method used was relatively long, we have then improved the simultaneous detection of the three parasites in leafy greens; the steps of elution and DNA extraction were optimized, and the processing time was reduced. This method is a qualitative method to efficiently detect low doses of parasites (0,04 - 40 (oo) cysts/g of vegetables). It was used to determine the prevalence of parasites in large samples of leafy greens (coriander, lettuce and parsley) purchased in Marrakech, between 2018 and 2019. The overall contamination was 32,2% (49/152) with 45 positive for T. gondii, 4 for G. duodenalis and none for Cryptosporidium spp., with a higher presence in autumn and winter than other seasons. We have also implemented a qualitative and low-cost method for the detection of the three parasites in water. This method was applied to investigate the presence of parasites in tap, well and spring waters collected in Marrakech between 2016 and 2020. It revealed an overall contamination of 67,3% (70/104) with 17 positive for T. gondii, 35 for G. duodenalis, 18 for both parasites, and none for Cryptosporidium spp., with no significant difference between the three types of water.Further investigations can be performed to acquire new epidemiological data on the health risk of waterborne and foodborne diseases in Morocco.

Abstract FR:

La contamination parasitaire de l’homme présente un problème majeur de santé publique. Elle serait directement ou indirectement imputée à la consommation d’eau et / ou d’aliments contaminés. Au Maroc, l’état actuel des connaissances épidémiologiques sur la transmission des parasites montre des lacunes, qu’il est essentiel de combler pour pouvoir établir des mesures efficaces de contrôle en matière de sécurité sanitaire des aliments.Dans ce contexte, nous avons d’abord conduit une étude exploratoire pendant un an (2017) pour évaluer la contamination par Cryptosporidium spp., Giardia duodenalis et Toxoplasma gondii de cinq légumes (carotte, coriandre, laitue, persil et radis) commercialisés à Marrakech. La recherche des trois formes parasitaires a été réalisée par microscopie (coloration de Ziehl-Neelsen modifiée), immunochromatographie et qPCR. L’analyse par qPCR a permis de mettre en évidence la présence de ces parasites avec un taux global de 21,21% (28/132) dont 22 positifs pour T. gondii, 6 pour G. duodenalis, et aucun pour Cryptosporidium spp. En revanche, ce dernier a été détecté par examen microscopique dans 4 échantillons de végétaux. Cependant, le traitement étant relativement long, nous étions amenés à améliorer la détection simultanée de ces trois parasites dans les végétaux à feuilles vertes. En effet, les étapes d’élution et d’extraction d’ADN ont été optimisées, et le temps de traitement a été réduit. La méthode optimisée, permettant de détecter de faibles doses de parasites (0,04 – 40 oocystes ou kystes/g de matrice) a été adoptée par la suite pour déterminer la prévalence des trois parasites dans un large échantillon de végétaux (coriandre, laitue et persil) achetés à Marrakech entre 2018 et 2019. Le taux de contamination était de 32,2% (49/152) dont 45 positifs pour T. gondii, 4 pour G. duodenalis, et aucun pour Cryptosporidium spp., avec une présence plus élevée en automne et en hiver. Nous avons également mis en place une méthode qualitative et peu coûteuse pour la détection des trois parasites dans l’eau par les techniques de détection déjà citées. Cette méthode a été appliquée dans les eaux de robinet, de puits et de source, entre 2016 et 2020 à Marrakech, et a révélé un taux de contamination global de 67,3% (70/104) dont 17 positifs pour T. gondii, 35 pour G. duodenalis, 18 pour les deux parasites, et aucun pour Cryptosporidium spp., sans différence significative entre les différents types d’eau analysés.D'autres investigations pourront être menées pour acquérir de nouvelles données épidémiologiques sur le risque sanitaire des maladies parasitaires d’origine alimentaire et hydrique au Maroc.