Etude par complementation et mutagenese dirigee des sequences virales impliquees dans le mouvement et la replication du virus des nervures jaunes et necrotiques de la betterave (bnyvv)
Institution:
Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)Disciplines:
Directors:
Abstract EN:
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Abstract FR:
Le virus des nervures jaunes et necrotiques de la betterave est l'agent responsable de la rhizomanie de la betterave sucriere. Le genome de ce phytovirus est constitue de 4 rna. Il porte sur son rna 2, un groupe de 3 genes (tgb) qui code pour 3 proteines de mouvement. Mon travail de these, comporte 4 parties axees principalement sur l'etude du mouvement du bnyvv. (1) des experiences de complementation heterologue, utilisant un replicon derive du rna 3, nous ont permis de montrer que les trois proteines de mouvement, codees par les virus a tgb, interagissent probablement, de maniere directe ou indirecte, au cours du transport de cellule a cellule. (2) en parallele, nous avons realise, par alanine scanning, une cartographie des domaines fonctionnels de la proteine tgbp2 (ou proteine p13) codee par le bnyvv. Cette proteine possede deux domaines hydrophobes separes par une sequence hydrophile tres conservee chez les differents virus a tgb. Si la presence des domaines hydrophobes est cruciale pour la fonction de la proteine, il semble que la sequence en aminoacides hydrophobes ne soit pas importante. En revanche, la sequence en aminoacides de la region conservee est indispensable a la fonction de mouvement. (3) le bnyvv necessite la presence du rna 3 pour son transport a longue distance chez beta macrocarpa. L'introduction de mutations ponctuelles et de deletions dans ce rna nous a permis de montrer qu'aucune des 3 proteines, potentiellement codees par le rna 3, n'est impliquee dans ce mecanisme. Il semble au contraire que cette fonction soit assuree par le rna lui-meme. (4) enfin, j'ai participe a l'etude de la structure secondaire en solution de l'extremite 3 terminale du rna 3.