Etude des interactions entre arn et proteines dans les mitochondries des plantes superieures
Institution:
Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)Disciplines:
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Les transcrits mitochondriaux de plantes sont l'objet de diverses maturations telles que l'epissage ou l'edition. Ces processus mettent en jeu des proteines capables d'interagir avec les arn, mais a ce jour seules quelques proteines de type rna-binding ont ete identifiees et leur role dans l'expression des genes inconnue. Notre intention etait d'identifier des proteines rna-binding par leur affinite pour l'arn. Nous avons suivi deux axes de recherche : le premier etait une etude in organello des proteines interagissant avec les arn en cours de synthese, le second une purification des proteines rna-binding par chromatographie d'affinite pour l'adn simple brin. Pour identifier les proteines interagissant avec les arn naissants, nous avons developpe un protocole de pontage covalent aux uv des proteines aux arn pendant une transcription run-on en presence de nucleotides radioactifs. Ce protocole a permis l'identification d'une proteine majoritaire de 38 kda dans les mitochondries de pomme de terre. Cette proteine est egalement presente dans un extrait de transcription in vitro et dans la fraction mac (mitochondrial active chromosome), indiquant que le marquage de cette proteine est vraisemblablement couplee a la transcription. Par chromatographie d'affinite, plusieurs proteines mitochondriales de pomme de terre presentant une forte affinite pour l'arn ont ete identifiees. La plupart de ces proteines possedent un motif n-terminal de fixation a l'arn de type rrm et un domaine tres riche en glycines. Ces proteines ont ete classees en deux familles : mrbp1 et mrbp2 (mitochondrial rna-binding protein). La proteine at-mrbp1a, membre de la famille mrbp1 chez arabidopsis thaliana, interagit avec une proteine de 42 kda et son expression semble inductible aux basses temperatures. Sa fonction est encore inconnue. Par ailleurs, une proteine de 40 kda ayant une forte affinite pour l'adn simple brin a ete purifiee, clonee et sa sequence peptidique presente un motif nouveau.