Analyse automatique et quantitative de cellules en culture par traitement d'images
Institution:
Paris 7Disciplines:
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L'utilisation des cultures cellulaires ne cesse de se generaliser dans les laboratoires de recherche ainsi que dans les industries pharmaceutiques. Ces systemes cellulaires permettent l'etude de drogues et de divers medicaments concernant leur toxicite, leur metabolisme et leur mecanisme d'action, tout en simplifiant la complexite cellulaire et moleculaire observee dans un organisme entier. Cette approche permet egalement de limiter l'emploi d'animaux de laboratoire. Cependant, le grand nombre de donnees apportees par ces tests exige une automatisation des analyses tout en fournissant des resultats objectifs et quantitatifs. Dans ce contexte, nous avons developpe un systeme d'analyse d'images permettant d'atteindre ces objectifs. L'effort a surtout porte sur la rapidite de l'analyse et sur la resolution des problemes specifiques liees aux cultures cellulaires par traitement d'images. Des etudes ont porte sur l'analyse des cellules non colorees, par la recherche d'un systeme microscopique approprie et par l'elaboration des algorithmes specifiques d'analyse d'images adaptes a la culture cellulaire. Le probleme de l'heterogeneite de l'eclairage au sein d'un puits de boite de culture a egalement ete etudie. Un algorithme original par modelisation mathematique a ete developpe pour resoudre ce probleme. Trois applications biologiques ont ete realisees afin de demontrer la versatilite et la fiabilite du systeme. Non seulement un comptage automatique par le systeme a permis d'estimer rapidement la densite cellulaire afin d'etudier la mort et la survie des cellules sous l'action de drogues, mais nous avons egalement pu apporter des informations precises sur les parametres morphologiques des cellules (surface, perimetre, facteur de forme) dans le but d'evaluer quantitativement la maturation et la differenciation cellulaire. Le systeme que nous avons developpe permet aussi de suivre l'evolution temporelle des cellules dans leur etat physiologique naturel (non colorees, vivantes). Cet instrument devrait etre tres utile pour les developpements futurs et les nouvelles orientations de la culture cellulaire.