Cartographie physique et transcriptionnelle dans la region critique pour la trisomie 21
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Paris 7Disciplines:
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La trisomie 21 humaine ou syndrome de down est la maladie congenitale la plus frequente (1 naissance sur 750). Elle est caracterisee par des signes cliniques variables incluant un retard mental constant. Une etude comparative du phenotype et du genotype patients porteurs de trisomie 21 partielle a permis de definir une region minimale appelee dcr1 (down syndrome chromosomal region 1) associee aux principaux traits phenotypiques observes. L'analyse moleculaire approfondie de cette region requiert l'etablissement d'une carte physique puis d'une carte transcriptionnelle detaillees afin d'en identifier tous les genes. Une carte genomique a d'abord ete etablie dans la partie centrale de la dcr1 (d21s55-d213267) a partir d'adn de lymphocytes analyse par electrophorese en champs pulses. Un contig de 16 yac a ensuite ete construit. Un degre de precision supplementaire a ete apporte par l'etude de cosmides constituant un contig partiel couvrant 80% de la region. La seconde etape a consiste en l'etablissement d'un carte transcriptionnelle entre d21s55 et d21s394. Nous avons utilise deux techniques differentes : la capture d'adnc et l'amplification d'exons. Ce travail a permis de repetorier 400 adnc positifs localises sur 32 fragments ecor1 differents. Les comparaisons de sequences avec les banques de donnees et les analyses par northern blots ont permis de definir 8 unites transcriptionnelles differentes dont 2 correspondent a des genes connus : minibrain, l'homologue humain d'un gene implique dans le developpement du systeme nerveux de la drosophile, et girk2, un canal potassique homologue au gene porteur de la mutation weaver chez la souris.