Abstract FR:

Nous présentons le développement de nouvelles techniques d'imagerie optique à haute résolution dans les tissus biologiques, qui sont des milieux fortement diffusants pour les longueurs d'ondes visible et proche infrarouge. La première partie de ce manuscrit rappelle les propriétés optiques caractéristiques des tissus et les différentes approches expérimentales existantes à ce jour pour l'imagerie optique en profondeur dans ces milieux. En particulier, nous passons en revue les techniques de microscopie formant le contexte de ce travail : la microscopie confocale, la tomographie optique cohérente (oct) et la microscopie de fluorescence avec excitation non linéaire. Une attention particulière est accordée a la description de l'oct, à laquelle plusieurs innovations ont été apportées dans le cadre ce travail. La partie suivante décrit deux appareils conçus et réalises au cours de cette thèse. Le premier a démontré pour la première fois qu'il est possible d'introduire sur un imageur oct un dispositif de détection parallèle utilisant une camera ccd, ce qui élimine d'avoir à balayer la source ou l'échantillon. Le microscope construit sur ce principe est décrit, et des images obtenues dans des tissus végétaux sont présentées. Le deuxième appareil a démontré pour la première fois qu'il est possible de combiner en un seul instrument un microscope oct a balayage et un microscope de fluorescence avec excitation a deux photons. Ces deux modes de contrastes étant intrinsèquement différents, ils permettent d'obtenir des informations complémentaires sur un tissu. Par exemple, une double image morphologique et fonctionnelle peut être enregistrée a plusieurs centaines de microns de profondeur avec une résolution micrométrique. Nous décrivons