thesis

Cartographie genetique et physique de maladies liees au chromosome x

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Jan. 1, 1995

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L'objectif de ce travail de these etait de localiser et caracteriser trois genes responsables de maladies hereditaires liees au chromosome x, par etude de liaison et clonage positionnel. Par etude de liaison, j'ai precise la localisation de deux locus mrx grace a des marqueurs microsatellites tres polymorphiques. Ces resultats ont grandement ameliores les valeurs de lod score et ont permis de delimiter les regions contenant les loci mrx2 et mrx4. Dans le but d'isoler le gene responsable de la surdite non syndromique dfn3, une carte physique de la region d'interet a ete construire par pfge ; j'ai aussi genere 8 stss par alu pcr afin de cartographie plusieurs deletions dans des patients dfn3 ainsi que des cosmides. Nous avons commence a isoler des sequences potentiellement exprimees quand un gene (pou3f4) responsable du phenotype chez certains patients a ete caracterise par f. Cremers, en dehors de notre region candidate. Plusieurs evidences semblaient demontrer qu'il existe un autre gene ou une sequence regulatrice dans notre region. La region candidate pour la myopathie myotubulaire a ete restreinte par l'etude de liaison avec des marqueurs genetiques et l'analyse moleculaire de trois patients deletes non apparentes. Plusieurs strategies ont ete utilisees pour isoler des genes candidats, comme la capture d'exons, l'cdna selection, le sous-clonage des ilots cpg, la conservation de fragments d'adn au cours de l'evolution et le sequencage au hasard et prediction informatique d'exons. Deux genes ont ete caracterises. Le premier etait preferentiellement exprime dans le muscle squelettique mais aucune mutations n'a ete trouvees chez les patients. Le second etait exprime de facon ubiquitaire a un niveau assez eleve, avec un transcrit alternatif specique du muscle. Plusieurs mutations ont ete trouvees qui detruisent la structure de la proteine confirmant que ce candidat etait bien le gene mtm1