Aspects moléculaires de l'intégration du rétrovirus HTLV-1 et de l'expansion clonale de sa cellule hôte
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Lille 1Disciplines:
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L'intégration est une étape fondamentale du cycle replicatif des rétrovirus. Si tout le génome cellulaire peut être le siège d'une intégration, des études menées in vitro ont montré que certaines régions semblaient plus souvent concernées que d'autres. Pour aborder cette question in vivo, nous avons séquencé plus de 200 sites d'intégration du virus htlv-1, à partir d'échantillons provenant d'individus infectés. L'étude montre que htlv-1 s'intègre dans les régions riches en a/t, caractérisées par une distribution nucléotidique inhomogène dans le voisinage immédiat du provirus et par une fréquence élevée de longs motifs a/t. Cette composition particulière suggère que l'intégration obéit à des contraintes structurales de l'ADN cellulaire. Ainsi, certains sites correspondent à des séquences intrinséquement courbées alors que d'autres ont une distribution nucléotidique apparemment propice à la fixation de protéines susceptibles d'en modifier la conformation.