Mathematical modeling of blood and bile flow in healthy and damaged liver micro-architecture
Institution:
Sorbonne universitéDisciplines:
Directors:
Abstract EN:
Counting among the six vital organs in the body, liver carries numerous functions. Among them, it regulates metabolites blood concentration, removes drug and toxins from the blood, and produces bile. Mathematical modeling of liver function is a subject of growing interest, especially in drug development. Nevertheless, most models do not take into account liver’s spatial arrangement at micro-scale, resulting in approximations. This thesis addresses two liver functions focusing on a single liver lobule, the smallest repetitive anatomical and functional tissue unit of liver: removal and metabolism of drugs and toxins from the blood (blood detoxification), and bile production. A resistive hemodynamics model of micro-circulation is proposed, based on a image-based representative generated liver lobule. To simulate convection-reaction equations (PDE) in liver capillaries modeling the transport and exchange of a compound, an extension of a finite volume scheme is developed. It is then coupled with a model of metabolism in the cells (ODE) that takes into account cell-to-cell variability. This model has been quantitatively compared to experiments in two presented cases. Finally, the second key flow system of liver: the biliary system, is addressed. An experiment-based mathematical model is proposed to determinate processes responsible for the movement of bile acids within liver micro-architecture.
Abstract FR:
Le foie, qui fait partie des six organes vitaux du corps humain, est garant de nombreuses fonctions. Entre autres, il est responsable de la régulation de la concentration de nombreux métabolites dans le sang, du retrait du sang des médicaments et toxines, et de la production de la bile. La modélisation mathématique de sa function est un sujet qui connaît un intérêt grandissant, notamment pour le développement de nouveaux médicaments. Cependant, la plupart des modèles ne prennent pas en compte l'organisation spatial de cette organe, plus particulièrement à l'échelle microscopique. Cette thèse propose un modèle mathématique de deux fonctions du foie: la détoxification du sang et la production de la bile, en se concentrant sur un lobule hépatique, unité formant le foie. Un modèle résistif de l'hémodynamique est proposé, qui prend en compte l'effet des globules rouges sur le flux du sang, dans un lobule representatif généré à partir de l'analyse d'images de foies de sours. Pour simuler le transport et les échanges d'un composé dans le sang, une équation de convection-reaction est résolue dans un réseau de capillaires. Une extension d'un schéma aux volumes finis est proposée dans cette optique. Cette EDP est couplée à un système d'EDO représentant le métabolisme du composé dans les cellules, prenant en compte la variabilité inter-cellulaire. Dans deux cas décrits dans ce manuscript, ce modèle fut comparé à des résultats expérimentaux. Enfin, le système biliaire est étudié et un modèle reproduisant un dispositif expérimental est proposé afin de déterminer quels processus sont responsables du mouvement des acides biliaires dans la micro-architecture du foie.